Mare Nostrum Lab jest jednym z czterech tzw. Projektów Flagowych Priorytetowego Obszaru Badawczego realizowanego w ramach specjalnego programu Inicjatywa Badawcza Uczelnie Badawcze Ministerstwa Nauki i Edukacji przyznanego dla najlepszych uczelni naukowych w Polsce.
Głównym celem Mare Nostrum Lab będzie nadanie nowego impulsu badaniom związanym z dziedzictwem kulturowym społeczeństw regionu Morza Śródziemnego. Rejon ten, o kluczowym znaczenia dla cywilizacji Europy, Bliskiego Wschodu i Północnej Afryki, jest w centrum zainteresowania wielu naukowców Uniwersytetu Jagiellońskiego. Badania będą rozwijane szczególnie w obszarze trzech, interdyscyplinarnych obszarów: badań archeometrycznych, czyli badań stosujących metody nauk ścisłych do badań dziedzictwa kulturowego, badań teledetekcyjnych, związanych z zastosowaniem nauk geograficznych do badań nad zjawiskami kulturowymi, oraz zastosowaniem nowoczesnych technik digitalizacyjnych do prezentacji zarówno dziedzictwa kulturowego, jak i wyników badań Projektu.
Jednak nie tylko badania naukowe będą priorytetem. Projekt zakłada również wprowadzenie nowej oferty dydaktycznej dla studentów Uniwersytetu Jagiellońskiego, która pozwoli wykształcić badaczy z nowymi kompetencjami nie tylko atrakcyjnymi z punktu widzenia rozwoju nauki, ale również w kontekście rynku pracy.
Wreszcie bardzo ważnym elementem Projektu będzie prezentowanie wyników badań i prac odbiorcy zewnętrznemu, zarówno społeczności akademickiej, jak i wszystkim zainteresowanym szeroko pojmowanym dziedzictwem cywilizacji Morza Śródziemnego.